Revista GTI

Vol. 15 Núm. 43 (2016): Revista GTI
Artículos

Alineamiento de secuencias bioinformáticas en una arquitectura GRID

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  • Simon Orozco-Arias,
  • Marcelo Herrera-González,
  • Leonardo Soto-Agudelo,
  • Gustavo Isaza-Echeverry
Simon Orozco-Arias
Universidad de Caldas
Biografía
Marcelo Herrera-González
Universidad de Caldas
Biografía
Leonardo Soto-Agudelo
Universidad de Caldas
Biografía
Gustavo Isaza-Echeverry
Universidad de Caldas
Biografía

Publicado 2017-10-11

Palabras clave

  • Computación HTC,
  • Grid,
  • Infraestructura Cluster,
  • Condor,
  • Blast

Cómo citar

Orozco-Arias, S., Herrera-González, M., Soto-Agudelo, L., & Isaza-Echeverry, G. (2017). Alineamiento de secuencias bioinformáticas en una arquitectura GRID. Revista GTI, 15(43), 37–45. Recuperado a partir de https://revistas.uis.edu.co/index.php/revistagti/article/view/6818

Resumen

Las tecnologías de la computación de altas prestaciones se han convertido en herramientas muy útiles, empleadas por diferentes empresas o centros de investigación para la ejecución de procesos y análisis de datos masivos en tiempo real, convirtiéndose en necesidades básicas para la mayoría de los procesos investigativos. Sin embargo, uno de los principales objetivos que se buscan al utilizar este tipo de sistemas es el empleo del menor tiempo posible de ejecución de procesos y una mayor precisión en los resultados. En este artículo se dará a conocer de manera general una arquitectura que satisface esas necesidades, como es el caso de una Grid Computing. También se presentará qué factores influyen en ella, qué elementos se deben configurar y cómo es el rendimiento al ejecutar trabajos bioinformáticos en esta arquitectura. Para ello se ejecutarán alineamientos usando NCBIBlast en diferentes nodos de cómputo ubicados dispersos geográficamente, finalmente se evidencia el desempeño que se obtiene al finalizar las tareas

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