Palabras clave
Adenovirus
Rhinovirus
Coinfección
Prevalencia
Gravedad
Santander
Colombia
Cómo citar
Resumen
Introducción: Las infecciones respiratorias agudas (IRA) causadas por virus respiratorios constituyen una fuente importante de morbilidad y mortalidad en el mundo. Nos propusimos determinar la prevalencia de virus respiratorios en pacientes con sospecha de infección por SARS-CoV-2 y explorar la asociación entre coinfección de SARS-CoV-2 con otros virus respiratorios con la gravedad de la enfermedad respiratoria aguda. Métodos: Estudio de corte transversal, se analizaron hisopados de pacientes con síntomas sugestivos de COVID-19 en Santander, Colombia. Se seleccionaron muestras positivas y negativas para SARS-CoV-2 mediante un muestreo probabilístico proporcional. La detección de 15 virus se realizó mediante RT-qPCR en hisopados almacenados a -80°C. Se tomaron datos clínicos y epidemiológicos de las fichas epidemiológicas remitidas junto con la muestra respiratoria, para establecer la condición de gravedad (hospitalización o muerte por IRA). Resultados: Se incluyeron 600 hisopados colectados entre abril del 2020 y noviembre del 2021. La mediana de edad de los pacientes fue 55,0 años [RIC: 34,0] y el 58,5% fueron hombres. La prevalencia de rinovirus y adenovirus C fue de 4,7% y 0,3%, respectivamente. La prevalencia de coinfección de SARS-CoV-2 con rinovirus y adenovirus C fue de 3,3% (IC95%: 1,7-5,5) y 0,3% (IC95%: 0,0-1,4), respectivamente. Al momento de la toma de muestras, el 30,2 % correspondía a pacientes ambulatorios, el 59,8 % a pacientes hospitalizados y el 10,0 % a casos fatales. Se observó una diferencia en el reporte de comorbilidades entre los casos y controles (61,0 % vs. 46,5 %; p = 0,012). No se encontró asociación entre coinfección y la gravedad de la enfermedad (OR: 1,01; IC95%: 0,33 - 3,10), ajustando por edad, sexo, seguridad social y comorbilidades. Conclusiones: Durante el periodo epidémico la circulación de otros virus respiratorios fue baja. No observamos una asociación entre coinfección y gravedad de la enfermedad en las muestras evaluadas.
Citas
Binns E, Koenraads M, Hristeva L, Flamant A, Baier-Grabner S, Loi M, Lempainen J, et al. Influenza and respiratory syncytial virus during the COVID-19 pandemic: Time for a new paradigm?. Pediatr Pulmonol. 2022; 57(1): 38-42. doi: https://doi.org/10.1002/ppul.25719
Weston S, Frieman MB. Respiratory viruses. In: Schmidt TM, editor. Encyclopedia of Microbiology. 4th ed. Academic Press; 2019: 85-101. doi: https://doi.org/10.1016/B978-0-12-801238-3.66161-5
Jee Y. WHO International Health Regulations Emergency Committee for the COVID-19 outbreak. Epidemiol Health. 2020; 42: e2020013. doi: https://doi.org/10.4178/epih.e2020013
Chow EJ, Uyeki TM, Chu HY. The effects of the COVID-19 pandemic on community respiratory virus activity. Nat Rev Microbiol. 2023; 21(3): 195-210. doi: https://doi.org/10.1038/s41579-022-00807-9
Alcaldía Mayor de Bogotá. Más de 80 % bajó mortalidad infantil por enfermedad respiratoria en cuarentena. 2020. [Internet] [Consultado 17 de julio de 2024]. Disponible en: https://bogota.gov.co/mi-ciudad/salud/enfermedades-respiratorias-disminuyeron-en-bogota.
Presti S, Manti S, Gambilonghi F, Parisi GF, Papale M, Leonardi S. Comparative Analysis of Pediatric Hospitalizations during Two Consecutive Influenza and Respiratory Virus Seasons Post-Pandemic. Viruses. 2023; 15(9): 1825. doi: https://doi.org/10.3390/v15091825
Orozco-Hernández JP, Montoya-Martínez JJ, Pacheco-Gallego MC, Céspedes-Roncancio M, Porras-Hurtado GL. Coinfección por SARS-CoV-2 y rinovirus-enterovirus en una paciente adulta joven críticamente enferma en Colombia. Biomédica. 2020; 40(Supl. 2): 34–43. doi: https://doi.org/10.7705/biomedica.5516
García-Posada M, Aruachan-Vesga S, Mestra D, Humánez K, Serrano-Coll H, Cabrales H, Faccini Á, et al. Clinical outcomes of patients hospitalized for COVID-19 and evidence-based on the pharmacological management reduce mortality in a region of the Colombian Caribbean. J Infect Public Health. 2021; 14(6): 696–701. doi: https://doi.org/10.1016/j.jiph.2021.02.013
Swets MC, Russell CD, Harrison EM, Docherty AB, Lone N, Girvan M, et al. SARS-CoV-2 co-infection with influenza viruses, respiratory syncytial virus, or adenoviruses. Lancet. 2022; 399(10334): 1463–1464. doi: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(22)00383-X
Le Glass E, Hoang VT, Boschi C, Ninove L, Zandotti C, Boutin A, et al. Incidence and Outcome of Coinfections with SARS-CoV-2 and Rhinovirus. Viruses. 2021; 13(12): 2528. doi: https://doi.org/10.3390/v13122528
Instituto Nacional de Salud. Lineamientos para la vigilancia por Laboratorio de virus respiratorios. Bogotá D.C.: Instituto Nacional de Salud; 2020. [Internet] [Consultado 17 de julio de 2024] Disponible en: https://www.ins.gov.co/buscador-eventos/Informacin%20de%20laboratorio/Lineamientos%20para%20la%20vigilancia%20por%20Laboratorio%20de%20virus%20respiratorios.pdf
Dare R, Sanghavi S, Bullotta A, Keightley MC, St. George K, Wadowsky RM, et al. Diagnosis of human metapneumovirus infection in immimosuppressed lung transplant recipients and children evaluated for pertussis. J Clin Microbiol. 2007; 45(2): 548–552. doi: https://doi.org/10.1128/jcm.01621-06
Ng KT, Chook JB, Oong XY, Chan YF, Chan KG, Hanafi NS, et al. Performance of a taqman assay for improved detection and quantification of human rhinovirus viral load. Sci Rep. 2016; 6: 34855. doi: https://doi.org/10.1038/srep34855
Shirreff G, Chaves SS, Coudeville L, Mengual-Chuliá B, Mira-Iglesias A, Puig-Barberà J, et al. Seasonality and Co‐Detection of Respiratory Viral Infections Among Hospitalised Patients Admitted With Acute Respiratory Illness—Valencia Region, Spain, 2010–2021. Influenza Other Respir Viruses. 2024; 18(10): e70017. doi: https://doi.org/10.1111/irv.70017
Pan L, Yuan Y, Cui Q, Zhang X, Huo Y, Liu Q, et al. Impact of the COVID-19 pandemic on the prevalence of respiratory viral pathogens in patients with acute respiratory infection in Shanghai, China. Front Public Health. 2024; 12: 1230139. doi: https://doi.org/10.3389/fpubh.2024.1230139
Cong B, Koç U, Bandeira T, Bassat Q, Bont L, Chakhunashvili G, et al. Changes in the global hospitalisation burden of respiratory syncytial virus in young children during the COVID-19 pandemic: a systematic analysis. Lancet Infect Dis. 2024; 24(4): 361–374. doi: https://doi.org/10.1016/S1473-3099(23)00630-8
Pan American Health Organization. Influenza and Other Respiratory Viruses: Surveillance in the Americas 2019. Washington D.C. PAHO; 2020. doi: https://doi.org/10.37774/9789275122785
Pan American Health Organization. Influenza and Other Respiratory Viruses: Surveillance in the Americas 2021. Washington D.C. PAHO; 2022. doi: https://doi.org/10.37774/9789275124994
García-Corzo JR, Niederbacher-Velásquez J, González-Rugeles C, Rodríguez-Villamizar L, Machuca-Pérez M, Torres-Prieto A, et al. Etiología y estacionalidad de las infecciones respiratorias virales en menores de cinco años en Bucaramanga, Colombia. Iatreia. Rev Univ Ind Santander Salud. 2017; 30(2): 107-116. doi: http://dx.doi.org/10.18273/revsal.v48n2-2016009
Park S, Michelow IC, Choe YJ. Shifting Patterns of Respiratory Virus Activity Following Social Distancing Measures for Coronavirus Disease 2019 in South Korea. J Infect Dis. 2021; 224(11): 1900–1906. doi: https://doi.org/10.1093/infdis/jiab231
Matera L, Manti S, Petrarca L, Pierangeli A, Conti MG, Mancino E, et al. An overview on viral interference during SARS-CoV-2 pandemic. Front Pediatr. 2023; 11: 1308105. doi: https://doi.org/10.3389/fped.2023.1308105
Piret J, Boivin G. Viral Interference between Respiratory Viruses. Emerg Infect Dis. 2022; 28(2): 273. doi: https://doi.org/10.3201/eid2802.211727
Li Y, Wang X, Msosa T, de Wit F, Murdock J, Nair H. The impact of the 2009 influenza pandemic on the seasonality of human respiratory syncytial virus: A systematic analysis. Influenza Other Respir Viruses. 2021; 15(6): 804–812. doi: https://doi.org/10.1111/irv.12884
Varela FH, Sartor ITS, Polese-Bonatto M, Azevedo TR, Kern LB, Fazolo T, et al. Rhinovirus as the main co-circulating virus during the COVID-19 pandemic in children. J Pediatr (Rio J). 2022; 98(6): 579–586. doi: https://doi.org/10.1016/j.jped.2022.03.003
Gil E, Roy S, Best T, Hatcher J, Breuer J. Increasing rhinovirus prevalence in paediatric intensive care patients since the SARS-CoV2 pandemic. J Clin Virol. 2023; 166: 105555. doi: https://doi.org/10.1016/j.jcv.2023.105555
Jain S, Self WH, Wunderink RG, Fakhran S, Balk R, Bramley AM, et al. Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Adults. New England Journal of Medicine. 2015; 373(5): 415–427. doi: https://doi.org/10.1056/NEJMoa1500245
Miller EK, Lu X, Erdman DD, Poehling KA, Zhu Y, Griffin MR, et al. Rhinovirus-associated hospitalizations in young children. J Infect Dis. 2007; 195(6): 773–781. doi: https://doi.org/10.1086/511821
Savolainen-Kopra C, Korpela T, Simonen-Tikka ML, Amiryousefi A, Ziegler T, Roivainen M, et al. Single treatment with ethanol hand rub is ineffective against human rhinovirus—hand washing with soap and water removes the virus efficiently. J Med Virol. 2012; 84(3): 543–547. doi: https://doi.org/10.1002/jmv.23222
Leung NHL, Chu DKW, Shiu EYC, Chan KH, McDevitt JJ, Hau BJP, et al. Respiratory virus shedding in exhaled breath and efficacy of face masks. Nat Med. 2020; 26(5): 676–680. doi: https://doi.org/10.1038/s41591-020-0843-2
Bordi L, Vulcano A, Sberna G, Nonis M, Giacomini P, Maggi F, et al. Co-Circulation of SARS-CoV-2 and Other Respiratory Pathogens in Upper and Lower Respiratory Tracts during Influenza Season 2022-2023 in Lazio Region. Microorganisms. 2023; 11(9). doi: https://doi.org/10.3390/microorganisms11092239
Kim YG, Park H, Kim SY, Hong KH, Kim MJ, Lee JS, et al. Rates of Coinfection Between SARS-CoV-2 and Other Respiratory Viruses in Korea. Ann Lab Med. 2022; 42(1): 110. doi: https://doi.org/10.3343/alm.2022.42.1.110
Heiselman CJ, Iovino N, Herrera KM. A case report of co-infection with rhinovirus and SARS-CoV-2 in pregnancy. Case Reports in Perinatal Medicine. 2020; 9(1). doi: https://doi.org/10.1515/crpm-2020-0028
Makovski TT, Ghattas J, Monnier-Besnard S, Cavillot L, Ambrožová M, Vašinová B, et al. Multimorbidity and frailty are associated with poorer SARS-CoV-2-related outcomes: systematic review of population-based studies. Aging Clin Exp Res. 2024; 36(1). doi: https://doi.org/10.1007/s40520-023-02685-4
Maltezou HC, Papanikolopoulou A, Vassiliu S, Theodoridou K, Nikolopoulou G, Sipsas N V. COVID-19 and Respiratory Virus Co-Infections: A Systematic Review of the Literature. Viruses. 2023; 15(4). doi: https://doi.org/10.3390/v15040865
Arias Ramos D, Restrepo Rueda DL, Rios Quintero EV, Olaya Gómez JC, Cortés Bonilla I. Severe and critical COVID-19 in a tertiary center in Colombia, a retrospective cross-sectional study. BMC Infect Dis. 2022; 22(1). doi: https://doi.org/10.1186/s12879-022-07246-0
Motta JC, Novoa D, Gómez CC, Moreno J, Vargas L, Pérez J, et al. Factores pronósticos en pacientes hospitalizados con diagnóstico de infección por SARS-CoV-2 en Bogotá, Colombia. Biomédica. 2020; 40: 116–130. doi: https://doi.org/10.7705/biomedica.5764
Ruiz-Sternberg ÁM, Chaparro-Solano HM, Albornóz LL, Pinzón-Rondón ÁM, Pardo-Oviedo JM, Molano-González N, et al. Genomic characterization of SARS-CoV-2 and its association with clinical outcomes: a 1-year longitudinal study of the pandemic in Colombia. Int J Infect Dis. 2022; 116: 91–100. doi: https://doi.org/10.1016/j.ijid.2021.12.326
Organización Panamericana de la Salud. Orientación ética sobre cuestiones planteadas por la pandemia del nuevo coronavirus (COVID-19). Washington, D.C.: OPS; 2020. [Internet] [Consultado 17 de julio de 2025]. Disponible en: https://iris.paho.org/handle/10665.2/52142
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